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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
저널정보
한국식물생명공학회 Journal of Plant Biotechnology Journal of Plant Biotechnology 제43권 제2호
발행연도
2016.1
수록면
181 - 188 (8page)

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In this study, we developed 15 novel polymorphic simple sequence repeat (SSR) markers by SSR-enriched genomic library construction from Codonopsis lanceolata. We obtained a total of 226 non-redundant contig sequences from the assembly process and designed primer sets. These markers were applied to 53 accessions representing the cultivated C. lanceolata in South Korea. Fifteen markers were sufficiently polymorphic, and were used to analyze the genetic relationships between the cultivated C. lanceolata. One hundred three alleles of the 15 SSR markers ranged from 3 to 19 alleles at each locus, with an average of 6.87. By cluster analysis, we detected clear genetic differences in most of the accessions, with genetic distance varying from 0.73 to 0.93. Phylogenic analysis indicated that the accessions that were collected from the same area were distributed evenly in the phylogenetic tree. These results indicate that there is no correlative genetic relationship between geographic areas. These markers will be useful in differentiating C. lanceolata genetic resources and in selecting suitable lines for a systemic breeding program.
#Codonopsis lanceolata #Marker #Medicinal plant #Simple sequence repeats #SSR) #Genetic relation

목차

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Badiane FA / 2012 / Genetic relationship of cowpea (Vigna unguiculata)varieties from senegal based on SSR markers / Genet Mol Res 11:292~304 google schola 방경환 / 2011 / SSR 마커를 이용한 국내산 인삼 품종 및 국외 수집종의 유전적 다양성 분석 / 한국약용작물학회지 19(5):347~353 dbpia Botstein D / 1980 / Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms / Am J Hum Genet 32:314~331 google schola 두홍승 / 2002 / 백두산지역과 국내 더덕 수입종의 RAPD에 의한 유연관계 분석 / 한국약용작물학회지 10(3):194~199 google schola Doyle JJ / 1987 / A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue / Phytochem Bull 19:11~15 google schola

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